ศาลมีอำนาจพิพากษางดหรือลดเบี้ยปรับตามที่เห็นสมควรแก่พฤติการณ์แห่งคดี และการอนุมัติให้จดทะเบียนภาษีมูลค่าเพิ่มย้อนหลังมีผลให้ผู้ประกอบการไม่ต้องรับผิดเ
คำสั่งกรมสรรพากรที่ ท.ป.81/2542 เป็นเพียงแนวปฏิบัติสำหรับเจ้าพนักงาน ไม่ผูกมัดศาล ศาลมีอำนาจพิพากษางดหรือลดเบี้ยปรับตามที่เห็นสมควร และเมื่อผู้ประกอบการได้รับอนุมัติให้จดทะเบียนภาษีมูลค่าเพิ่มย้อนหลัง ถือเป็นผู้ประกอบการจดทะเบียนนับแต่วันที่ระบุ มีสิทธิเสียภาษีมูลค่าเพิ่มโดยคำนวณจากภาษีขายหักด้วยภาษ
ศาลฎีกาพิพากษาแก้เป็นว่า ให้เพิกถอนการประเมินเบี้ยปรับตามหนังสือแจ้งการประเมินและคำวินิจฉัยอุทธรณ์เฉพาะส่วนเบี้ยปรับ และให้จำเลยคืนเงินค่าภาษีซื้อและเงินเพิ่มที่โจทก์ชำระไว้แล้วจำนวน 107,488.73 บาทแก่โจทก์
โจทก์ขายสินค้าและออกใบกำกับภาษีในเดือนธันวาคม 2556 โดยยังไม่ได้จดทะเบียนภาษีมูลค่าเพิ่ม ต่อมาโจทก์ยื่นจดทะเบียนย้อนหลังและชำระค่าปรับ เจ้าพนักงานอนุมัติให้จดทะเบียนย้อนหลังตั้งแต่วันที่ 6 ธันวาคม 2556 หลังจากนั้นเจ้าพนักงานประเมินเรียกเก็บภาษีซื้อ เงินเพิ่ม และเบี้ยปรับ
ฎีกาตัดสินเกี่ยวกับปัญหาข้อกฎหมายคำพิพากษาศาลฎีกาที่ 2137/2561บริษัทบลู เอ็นเนอร์จี่ โซลูชั่น จำกัดโจทก์กรมสรรพากรจำเลย ป.รัษฎากร ม. 85 คำสั่งกรมสรรพากรที่ ท.ป.81/2542 คำสั่งกรมสรรพากรที่ ท.ป.81/2542 เรื่อง หลักเกณฑ์การงดหรือลดเบี้ยปรับหรือเงินเพิ่ม ภาษีเงินได้ ภาษีมูลค่าเพิ่ม และภาษีธุรกิจเฉพาะตามมาตรา 22, 26, 67 ตรี, มาตรา 89 และมาตรา 91/21 (6) แห่ง ป.รัษฎากร เป็นการกำหนดหลักเกณฑ์เพื่อให้เจ้าพนักงานสรรพากรถือเป็นแนวปฏิบัติ หามีผลผูกมัดให้ศาลต้องถือตามด้วยไม่ ศาลมีอำนาจพิพากษางดหรือลดเบี้ยปรับตามที่เห็นสมควรแก่พฤติการณ์แห่งคดี จำเลยอนุมัติให้โจทก์จดทะเบียนภาษีมูลค่าเพิ่มย้อนหลังตั้งแต่วันที่ 6 ธันวาคม 2556 ผลแห่งการที่โจทก์ได้รับอนุมัติให้จดทะเบียนภาษีมูลค่าเพิ่มย้อนหลัง ถือว่าโจทก์เป็นผู้ประกอบการจดทะเบียนตั้งแต่วันที่ 6 ธันวาคม 2556 โจทก์ย่อมมีสิทธิเสียภาษีมูลค่าเพิ่มโดยคำนวณจากภาษีขายหักด้วยภาษีซื้อในแต่ละเดือนภาษี โดยโจทก์ไม่ต้องรับผิดเบี้ยปรับและเงินเพิ่มตามการประเมินโจทก์ฟ้องขอให้เพิกถอนคำวินิจฉัยอุทธรณ์ของคณะกรรมการพิจารณาอุทธรณ์ เลขที่ สภ.3(อธ.1)283/2557 ฉบับลงวันที่ 18 กันยายน 2557 และหนังสือแจ้งการประเมินภาษีมูลค่าเพิ่มของสำนักงานสรรพากรพื้นที่กรุงเทพมหานคร 30 เลขที่ ภ.พ.73.1-03030200-25570228-005-0004-8 ฉบับลงวันที่ 28 กุมภาพันธ์ 2557 ให้จำเลยคืนเงิน 107,488.73 บาท ให้แก่โจทก์ จำเลยให้การขอให้ยกฟ้อง ศาลภาษีอากรกลางพิพากษาให้แก้ไขคำวินิจฉัยอุทธรณ์ของคณะกรรมการพิจารณาอุทธรณ์ เลขที่ สภ.3(อธ.1)283/2557 ฉบับลงวันที่ 18 กันยายน 2557 และหนังสือแจ้งการประเมินภาษีมูลค่าเพิ่มของสำนักงานสรรพากรพื้นที่กรุงเทพมหานคร 30 เลขที่ ภ.พ.73.1-03030200-25570228-005-00048 ฉ